アガロース電気泳動法

　プラスミドはアガロースゲル電気泳動法を用いて確認することができる。ＤＮＡ断片がゲル中を移動する速度はその長さにより異なり、大きい断片ほどの移動距離は短くなる（ＤＮＡは-極から＋極の方へ移動する）。泳動後、エチジウム・ブロミドにより、ＤＮＡ断片を蛍光により検出できる。

準備：

50倍ＴＡＥ緩衝液：2M Tris-Acetate pH8.0, 0.1M EDTA
色素液：6倍濃度（グリセリン、BPB、XC）
エチジウム・ブロミド溶液（10mg/ml）：強い発ガン性があり、取り扱いに注意!!

方法：

1. １倍ＴＡＥ（約１litter）緩衝液を準備する。
2. 三角コルベンに寒天を1ｇ量って入れ、100mlの１倍ＴＡＥ緩衝液を加え、電子レンジで完全に溶かす。（電子レンジで溶かす前にアガロースと１倍ＴＡＥ緩衝液を十分に混ぜること）
3. アガロースが冷めたところで（約50℃）コームをセットしたゲル作成用のホルダーへ注ぐ。この時空気の泡が入らないように注意し、入った場合には滅菌したパスツール・ピペットで取り除く。
4. 完全に固化したところでコームを垂直に上げて取り除き、ゲルをホルダーごと泳動漕へ移し、静かに１倍ＴＡＥ緩衝液をゲルが液面の下になるまで加える。
5. 5μlのDNA溶液と1μlの色素液をパラフィルム上で混合し、全量をゲル穴に加える。
6. 100Ｖで約30分間泳動する。電気泳動中は高電圧になるのでくれぐれも注意すること！
7. 色素のバンドがゲルの3分の2に達したところで泳動を止め、ゲルを取り出し、0.5-1μｇの濃度のエチジウム・ブロミドの入った容器へ移し、ゆっくり振盪して20分間染色する。
8. ゲルを蒸留水の入った容器へ移し、脱染色する。
9. ＵＶイルミネーターでＤＮＡのバンドを観察し、写真撮影する。