放射線管理部門は放射性同位元素や放射線発生装置、核燃料物質の管理を行う部門です。これらの物質や装置のように人体に危険を及ぼす恐れのあるものは関連法令に従った厳重な管理を求められています。その一方で、化学分析・トレーサ実験・年代測定などの基礎科学、X線撮影・放射線治療・新薬開発などの医療関連、工業製品の検査、原子力発電など生活に密接するさまざまな分野で利用されています。すなわち、学術の進歩、産業の振興、国民の生活の水準向上などに資する場合の平和的な利用は許されているのです。ただし、そのためには、民主的な運営のもとに、自主的に行い、その成果を公開する、ことが求められています。これらの要求に応えるために、本部門では、使用計画の審査・承認、業務従事者の登録・健康診断および教育訓練の実施、放射性同位元素・核燃料物質の仕様および保管状況の管理、施設の点検、関係省庁との連絡などを行っています。