植野研究室便利帳：研究版

LinkIcon 大学トップ生活環境学部生活健康学系食物栄養学科院・人間文化研究科 English

タンパク質関連

タンパク質研究用サーバー
．BRENDA ・UCL Bioinformatics Server ．CATH Protein Structure Classification ．ProtoMap ．Prosite ．GRASS ・SCOP ・Pfam ・sosui ・Oxform Molecular Group ・European Bioinformatics Institute BioCatalog ・DNAMAN
Protein Movie Generator (PMG)

・Prolysis ・Merops

アミノ酸配列よりpIとMrの計算：
・Compu pI/Mw tool
DNA・RNA配列よりアミノ酸配列を予測：
・ExPASy - Translate tool
タンパク質の構造データベース
・New PDBのホーム・ミラーサイト（阪大タンパク研）・ミラーサイト（Rutgers）・ミラーサイト（NIST）・Prot-Web＠Johns Hopkins U

3/1-letter amino acid convert
Sequence manipulation suite

タンパク質のドメイン解析
・Protein Domain Server ・DSC (Discrimination of Protein Secondary Structure Class) ・The PredictProtein server　（本家）

・配列相同性

・Sequence Alignment
・[CLUSALW][its Old form]
・multi-align
・Biology Workbench
・SIM
・Macaw for Windows
・MultiAlin
・LALNView
・Sequence Alignment Software List
・Catalogue of Molecular Biology Programs
・

タンパク質の微細構造解析

・CAST
・Voidoo
・N-Glycan

タンパク質の結晶化

・Heavy-Atom Databank
・PREPI(Protein Representations Interactively)

タンパク質・化学構造式の表示ソフト

・AlphaSite
・Amber
・CINEMA
・Cn3D
・DOCK
・DS Viewer Pro
・EyeChem
・HyperChem
・ISIS Draw
・MAGE
・MidasPlus
・MolMol
・Molscript
・PREPI
・Pymol
・RasMol
・RasTop
・Swiss-PdbViewer
・Vector NTI Viewer
・WebLab Viewer ACS
・Xmol・

・ゲル解析法

2D Gel Analysis - QUEST at Cold Spring Harbor Laboratory

･検索エンジン

辞書検索

遺伝子関連

･検索エンジン（データベース）
ゲノムネット RU-Toolkit Exon-Intron Database EMBL Nucleotide Sequence Database BLAST BLAT Ensembl BLAST	NCBI - NIH Biology Workbench (1)(2)(3)(4) DNA Data Bank of Japan GenBank SSAHA

DNA配列からの検索：ゲノムネット・遺伝研

・発現配列タグ集合化データベース
STACK TIGR Gene Indices UniGene

・制限酵素サイト検索

・遺伝子コドン表

・Webcutter	Codon Usage Tables (Indiana U) (Harvard U)
・Restriction Enzyme Database
・REBASE

発注関連

PCR Primer

Vector ライブラリー

Primer order: JBioS
Primer Primo Primer3　Primer3 Univ. Wisconsin (River Falls)　Alkami Biosystems Web primer

Vectordb (also 1)
pBluescript vector
pYES2 vector
pT7Blue vector

ゲノム関連

ゲノムデータベース検索

ヒトゲノムセンター

酵母実験マニュアル・菌体コレクション・ソフトウェアー

モデル生物ゲノムデータベース

ゲノムの注釈データ

実験手法一般

Lab Methods - University of Cape Town
Pedro's BioMolecular　 Research Tools
BioMolecular Engineering Research Center at Boston Univ.
Australian National Genomic Information Service (ATCC)

ヒト遺伝地図・物理地図
・Nucleic Acids Research Database Collection
・Bacterial artificial chromosome and accession maps
・GenAtlas
・Genebridge4 radiation hybrid maps
．GeneMap '99
．GenMapDB
．Genethon linkage map
．HuGeMap
．Marshfield genetic maps
・RHdb
・Stanford G3 and TNG radiation hybrid maps

ヒト変異，多型，医学的情報，発現データの提供

遺伝学・ゲノム科学教育的資材

LinkIcon 研究活動教育方針業績研究室のHP 編集委員 English

ページトップへ

文献関連

研究情報

PubMed

ペドロ文献リスト

Cambridge Scientific Abstracts

Agricultural Biotechnology Information Center

産業技術総合研究所
やさしい科学解説（科学教室・Virtual Museum・Dream Lab）

ノーベル賞

Impact Factor 2009年度
（研究室からのみ閲覧できます）

ABC順 (サイズにご注意）

Score順

Citation Index

Institute for Scientific Information

学術雑誌

CiNiiでの閲覧
生化学系
	Biochemistry
	Biochim. Biophys. Acta - Protein Structure and Molecular Enzymology
	Bioscience, Biotechnology and Biochemistry
	Cell
	European Journal of Biochemistry
	FEBS Letter
	J American Chemical Society
	J Biochemistry
	J Biological Chemistry
	J Biol. Macromol
	J. Food Prot.
	J Molecular Catalysis B: Enzymatic
	J. Neuroscience
	Nature (Japan site)
	Nature Structural Biology
	Proceedings of the National Academy of Sciences (USA)
	Protein Expression and Purification
	Protein and Peptide Letters (Bentham Science Publisher)
	Protein Science
	Science

外国の出版社リスト

	The Scientific World
	HighWire Press
	ChemPort
	BioMedNet
	ChemWeb
	Information Quest
	Academic Press Journal List
	Elsevier
	HighWire Press
	Springer-Journal link
	Nilesのリンクリスト